Strains |
Strain Designationsa, b
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16S rRNA Gene Analysis Resultsc
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Difference Between Max Scoresd
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NCBI –BLAST Species Interpretation |
Vitek 2 NH Identificatione
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N. cinerea |
CCUG 2156T
|
904 (N. meningitidis)/ 897 (N. polysaccharea)/893 (N. cinerea) // 504 |
-11 |
Confirmed |
Correct |
N. cinerea |
CCUG 346 |
758 / 753 (N. meningitidis / N. polysaccharea) // 420 |
5 |
Confirmed |
Correct |
N. cinerea |
CCUG 5746 |
924 (N. meningitidis)/915( N. cinerea) // 515 |
-9 |
Confirmed |
Low Discrimination |
N. elongata subsp.elongata |
CCUG 30802T
|
693 / 625 (N. subflavia / N. animalis) // 384 |
68 |
Confirmed |
Correct |
N. elongata subsp.elongata |
CCUG 9686 |
879 / 774 (N. animalis) // 492 |
105 |
Confirmed |
Correct |
N. elongata subsp.elongata |
SSI: AB 2895 |
909 / 798 (N. animalis) // 502 |
111 |
Confirmed |
Correct |
N. gonorrhoeae |
CCUG 26876T
|
585 / 562 (N. cinerea) // 329 |
23 |
Confirmed |
Correct |
N. gonorrhoeae |
SSI: 189/2006 |
904 / 850 (N. meningitidis) // 501 |
54 |
Confirmed |
Correct |
N. gonorrhoeae |
SSI: 196/2006 |
915 / 861 (N. meningitidis) // 507 |
54 |
Confirmed |
Correct |
N. gonorrhoeae |
SSI: 199/2006 |
805 / 760 (N. meningitidis) // 447 |
45 |
Confirmed |
Correct |
N. gonorrhoeae |
SSI: 218/2006 |
823 / 773 (N. meningitidis) // 456 |
50 |
Confirmed |
Low Discrimination |
N. gonorrhoeae |
SSI: 223/2006 |
921 / 866 (N. meningitidis) // 510 |
55 |
Confirmed |
Correct |
N. gonorrhoeae |
SSI: 253/2006 |
854 / 800 (N. meningitidis) // 487 |
46 |
Confirmed |
Low Discrimination |
N. gonorrhoeae,
proAf neg.
|
SSI: 177/2002 |
675 / 643 (N. cinerea) // 374 |
32 |
Confirmed |
Misidentified |
N. gonorrhoeae,
proA neg. |
SSI: 67/2002 |
765 / 729 (N. meningitidis) // 428 |
36 |
Confirmed |
Misidentified |
N. gonorrhoeae,
proA neg. |
SSI: 52/2002 |
904 / 850 (N. meningitidis) // 501 |
54 |
Confirmed |
Misidentified |
N. lactamica |
CCUG 5853T
|
717 / 675 (N. polysaccharea) // 406 |
42 |
Confirmed |
Correct |
N. lactamica |
SSI: BH 67320 |
794 / 791 (N. polysaccharea) // 518 |
3 |
Probable |
Correct |
N. meningitidis |
CCUG 3269T
|
937 / 913 (N. polysaccharea) // 507 |
24 |
Confirmed |
Correct |
N. meningitidis |
SSI: 17/2006 |
937 / 904 (N. cinerea) // 513 |
33 |
Confirmed |
Correct |
N. meningitidis |
SSI: 18/2006 |
828 / 798 (N. polysaccharea) // 452 |
30 |
Confirmed |
Correct |
N. meningitidis |
SSI: 19/2006 |
924 / 889 (N. cinerea) // 503 |
35 |
Confirmed |
Low Discrimination |
N. meningitidis |
SSI: 20/2006 |
902 / 878 (N. polysaccharea) // 501 |
24 |
Confirmed |
Correct |
N. meningitidis |
SSI: 21/2006 |
913 / 889 (N. polysaccharea) // 504 |
24 |
Confirmed |
Correct |
N. meningitidis |
SSI: 50/2006 |
893 / 863 (N. cinerea) // 489 |
30 |
Confirmed |
Correct |
N. meningitidis |
SSI: 23/2006 |
918 / 900 (N. cinerea) // 503 |
18 |
Confirmed |
Correct |
N. meningitidis |
SSI: 60/2004 |
915 / 880 (N. cinerea) // 502 |
35 |
Confirmed |
Correct I |
N. meningitidis |
SSI: 109/1998 |
913 / 888 (N. polysaccharea) // 501 |
25 |
Confirmed |
Correct |
N. sicca |
CCUG 23929T
|
859 / 854 (N. pharyngis) // 483 |
5 |
Probable |
Correct I |
N. sicca |
SSI: "19343" |
884 / 845 (N. pharyngis) // 498 |
39 |
Confirmed |
Correct |