Table 1b: Identification Results Obtained by Partial 16S rRNA Gene Sequence Analysis and by Vitek 2 NH Characterization of 30 Neisseria Species Strains Included in the Vitek 2 NH Database

Strains Strain Designationsa, b 16S rRNA Gene Analysis Resultsc Difference Between Max Scoresd NCBI –BLAST Species Interpretation Vitek 2 NH Identificatione
N. cinerea CCUG 2156T 904 (N. meningitidis)/ 897 (N. polysaccharea)/893 (N. cinerea) // 504 -11 Confirmed Correct
N. cinerea CCUG 346 758 / 753 (N. meningitidis / N. polysaccharea) // 420 5 Confirmed Correct
N. cinerea CCUG 5746 924 (N. meningitidis)/915( N. cinerea) // 515 -9 Confirmed Low Discrimination
N. elongata subsp.elongata CCUG 30802T 693 / 625 (N. subflavia / N. animalis) // 384 68 Confirmed Correct
N. elongata subsp.elongata CCUG 9686 879 / 774 (N. animalis) // 492 105 Confirmed Correct
N. elongata subsp.elongata SSI: AB 2895 909 / 798 (N. animalis) // 502 111 Confirmed Correct
N. gonorrhoeae CCUG 26876T 585 / 562 (N. cinerea) // 329 23 Confirmed Correct
N. gonorrhoeae SSI: 189/2006 904 / 850 (N. meningitidis) // 501 54 Confirmed Correct
N. gonorrhoeae SSI: 196/2006 915 / 861 (N. meningitidis) // 507 54 Confirmed Correct
N. gonorrhoeae SSI: 199/2006 805 / 760 (N. meningitidis) // 447 45 Confirmed Correct
N. gonorrhoeae SSI: 218/2006 823 / 773 (N. meningitidis) // 456 50 Confirmed Low Discrimination
N. gonorrhoeae SSI: 223/2006 921 / 866 (N. meningitidis) // 510 55 Confirmed Correct
N. gonorrhoeae SSI: 253/2006 854 / 800 (N. meningitidis) // 487 46 Confirmed Low Discrimination
N. gonorrhoeae, proAf neg. SSI: 177/2002 675 / 643 (N. cinerea) // 374 32 Confirmed Misidentified
N. gonorrhoeae, proA   neg. SSI: 67/2002 765 / 729 (N. meningitidis) // 428 36 Confirmed Misidentified
N. gonorrhoeae, proA   neg. SSI: 52/2002 904 / 850 (N. meningitidis) // 501 54 Confirmed Misidentified
N. lactamica CCUG 5853T 717 / 675 (N. polysaccharea) // 406 42 Confirmed Correct
N. lactamica SSI: BH 67320 794 / 791 (N. polysaccharea) // 518 3 Probable Correct
N. meningitidis CCUG 3269T 937 / 913 (N. polysaccharea) // 507 24 Confirmed Correct
N. meningitidis SSI: 17/2006 937 / 904 (N. cinerea) // 513 33 Confirmed Correct
N. meningitidis SSI: 18/2006 828 / 798 (N. polysaccharea) // 452 30 Confirmed Correct
N. meningitidis SSI: 19/2006 924 / 889 (N. cinerea) // 503 35 Confirmed Low Discrimination
N. meningitidis SSI: 20/2006 902 / 878 (N. polysaccharea) // 501 24 Confirmed Correct
N. meningitidis SSI: 21/2006 913 / 889 (N. polysaccharea) // 504 24 Confirmed Correct
N. meningitidis SSI: 50/2006 893 / 863 (N. cinerea) // 489 30 Confirmed Correct
N. meningitidis SSI: 23/2006 918 / 900 (N. cinerea) // 503 18 Confirmed Correct
N. meningitidis SSI: 60/2004 915 / 880 (N. cinerea) // 502 35 Confirmed Correct I
N. meningitidis SSI: 109/1998 913 / 888 (N. polysaccharea) // 501 25 Confirmed Correct
N. sicca CCUG 23929T 859 / 854 (N. pharyngis) // 483 5 Probable Correct I
N. sicca SSI: "19343" 884 / 845 (N. pharyngis) // 498 39 Confirmed Correct

a-e see Table 1a.
f proA: proline A arylamidase.