Table 2: The nucleotide based genome homology of different NDVs isolated from a wide range of wild/feral birds

% Nucleotide Divergence and Homology Between Each Pair of Isolates
Chicken Pigeon Muscovy
duck
Peacock Turkey Goose Cormorant Dove Pheasant Quail Mallard Sterna Northern
pintail
Red
knot
Herring
gull
Pelican Scarlet
macaw
Hawk Amazon
parrot
Chicken 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01
Pigeon 0.17 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
Muscovy
duck
0.17 0.11 0.01 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
Peacock 0.14 0.14 0.13 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
Turkey 0.18 0.15 0.14 0.15 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
Goose 0.17 0.12 0.01 0.14 0.15 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
Cormorant 0.18 0.15 0.13 0.16 0.10 0.14 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01
Dove 0.15 0.12 0.11 0.12 0.06 0.11 0.07 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 0.01
Pheasant 0.18 0.13 0.08 0.15 0.15 0.08 0.16 0.13 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
Quail 0.15 0.13 0.11 0.13 0.07 0.11 0.08 0.01 0.14 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 0.01
Mallard 0.11 0.16 0.16 0.13 0.18 0.16 0.18 0.15 0.17 0.16 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
Sterna 0.18 0.12 0.09 0.14 0.14 0.09 0.15 0.12 0.11 0.12 0.17 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
Northern
pintail
0.10 0.16 0.15 0.14 0.17 0.15 0.17 0.15 0.16 0.15 0.04 0.16 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
Red
knot
0.14 0.17 0.16 0.15 0.17 0.17 0.19 0.16 0.17 0.16 0.12 0.16 0.12 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
Herring
gull
0.18 0.15 0.14 0.16 0.11 0.14 0.04 0.08 0.16 0.09 0.18 0.15 0.18 0.19 0.00 0.01 0.01 0.01
Pelican 0.18 0.15 0.14 0.16 0.10 0.14 0.04 0.08 0.16 0.08 0.18 0.15 0.17 0.18 0.01 0.01 0.01 0.01
Scarlet
macaw
0.16 0.13 0.11 0.13 0.07 0.12 0.08 0.02 0.14 0.01 0.16 0.13 0.16 0.17 0.09 0.08 0.01 0.01
Hawk 0.02 0.17 0.17 0.14 0.18 0.17 0.19 0.15 0.18 0.15 0.11 0.17 0.10 0.14 0.18 0.18 0.16 0.01
Amazon
parrot
0.11 0.15 0.14 0.13 0.16 0.15 0.17 0.13 0.14 0.14 0.10 0.14 0.09 0.08 0.17 0.16 0.15 0.11

Back to Article